O Y6 (2019) é o mais recente smartphone da Huawei a ser actualizado com a interface de utilizador EMUI 9.1, a qual é baseada no Android 9 Pie.
Esta actualização de 2,35GB, que se encontra disponível para download over-the-air (OTA) em alguns países, adiciona ao smartphone Y6 (2019) o suporte para o EROFS (Extendable Read-Only File System), várias optimizações, bem como o GPU Turbo 3.0, uma funcionalidade que permite que o utilizador tenha uma experiência de jogo aprimorada.
Adicionalmente, a empresa de Shenzhen, China, reforça a segurança do Y6 (2019) com o patch de Julho da Google, o qual corrige várias falhas de segurança no sistema operativo Android.